Sau khi chiến tranh kết thúc, Waldman trở lại Notre Dame, nơi ông tiếp tục nghiên cứu về sự tích hợp quang của deuterium và berili.[4] Trong một thời gian, ông phụ trách máy gia tốc hạt 3 triệu vôn, là nguồn phát tia X mạnh thứ nhì thế giới vào năm 1949.[1] Năm 1960, Waldman xin nghỉ phép từ Notre Dame để trở thành giám đốc Phòng thí nghiệm của Hiệp hội Nghiên cứu Các trường Đại học Trung Tây (MURP). Ông bắt đầu khắc phục sự cố với máy gia tốc 50 MeV. Những vấn đề này đã được giải quyết, nhưng Chính phủ Liên bang từ chối tài trợ cho các hoạt động của MURP, và Walden quay trở lại Notre Dame vào năm 1964.[4] Vào năm 1967, Waldman được bổ nhiệm làm hiệu trưởng Trường Cao đẳng Khoa học Notre Dame. Ông giữ chức vụ này cho đến tháng 8 năm 1979, khi ông nghỉ hưu ở tuổi 65. Sau đó, ông trở thành phó giám đốc Phòng thí nghiệm Cyclotron Siêu dẫn Quốc gia tại Đại học Bang Michigan, cho đến năm 1983.

Waldman qua đời tại một bệnh viện ở Sanford, Bắc Carolina, nơi ông đang điều trị bệnh ung thư, vào ngày 1 tháng 11 năm 1986. Gia quyến ông gồm người vợ là Glenna và ba cô con gái.[1] Một lễ tang được tổ chức tại Vương cung thánh đường Thánh Tâm trong khuôn viên Đại học Notre Dame, và ông được an táng tại Nghĩa trang Cedar Grove.[9] Các xuất bản của ông đều nằm trong Văn khố Đại học Notre Dame.[10]